MLPA技術,即多重連接探針擴增技術,于2002年首先報道,是近幾年發(fā)展起來的一種針對待檢DNA序列進行定性和半定量分析的新技術。該技術高效、特異,在一次反應中可以檢測45個核苷酸序列拷貝數(shù)的改變,已經(jīng)應用于多個領域、多種疾病的研究。下面讓我們一起來看看MLPA技術的試驗原理吧!
在MLPA實驗中,純化的樣本DNA被變性。之后用MLPA探針寡核苷酸孵育過夜。每個MLPA探針都具有針對特定基因組序列的探針。每對MLPA探針包括兩條單鏈DNA:左側探針和右側探針寡核苷酸。簡稱分別是LPO和RPO。LPO和RPO包含PCR引物和DNA雜交序列。
在MLPA反應中,左探針寡核苷酸(LPO)和右探針寡核苷酸(RPO)都與靶序列進行雜交,之后使用連接酶連接兩部分探針。
將雜交的探針寡核苷酸連接到鄰近的目標序列。探針連接產(chǎn)物的數(shù)量是樣品中目標序列數(shù)量的度量。連接反應具有高度特異性,連接部位周圍沒有錯配。
使用單個通用引物對在多重PCR中擴增連接的探針。只有連接的探針呈指數(shù)級擴增,使得不需要去除未連接和未連接的探針。
再通過毛細管電泳進行片段分離,通過MRC Holland的分析軟件進行分析得出結論。PCR產(chǎn)物裝載到毛細管電置上,按長度分離。每個片段對應一個特定的MLPA探針。
MLPA結合了DNA探針雜交和PCR技術,不僅可以用來檢測與疾病相關的CNV(?拷貝數(shù)變異)?,?例如遺傳性乳腺癌、?結腸癌、?杜氏肌營養(yǎng)不良等,?還可以用于腫瘤中的CNV檢測,?以優(yōu)化腫瘤分型。任何技術都有其優(yōu)缺點。
優(yōu)點:
1、高效:一次反應可以檢測45個靶序列拷貝數(shù)的改變。
2、特異:可以檢測點突變。
3、快速:一次實驗可以在24小時內(nèi)完成。
4、簡便:不同的試劑盒操作基本相同,容易掌握。
缺點:
1、需要精確測量DNA的濃度,樣本容易被污染。
2、不能用于單個細胞的檢測。
3、MLPA用于檢測基因的缺失或重復,不適合檢測未知的點突變類型。
4、不能檢測染色體的平衡易位。